盆栽果蔬种植应在温室、塑料大棚等保护地内进行，利用设施所具有的较强的环境调控能力，减少病害的发生；同时在通风口处设防虫网，可防止虫害发生。盆栽果蔬对肥水要求更为严格，因此应装备灌溉施肥一体化系统。肥料通常选用无机营养液，具有营养全面、含量高、干净等优点，还克服了小容器操作难的缺点，利于家庭和餐厅摆放。基质采用无土栽培基质，如椰丝、泥炭、蛭石、珍珠岩等，不但美观、轻便，且有利于植株生长。对于部分观果类盆栽果蔬，如观赏番茄、观赏椒、观赏茄子等，需要整枝，避免徒长，促进多分枝。对于观赏瓜类，应设立支架。
掌握栽培技术是种植盆栽果蔬的重点。盆栽果蔬比普通果蔬的标准化要求更高、栽培技术要求更精准，例如对肥水要求更为严格、修剪整形上也比普通果蔬要求多一些。种植盆栽果蔬应在温室、塑料大棚等保护地内进行，这是因为温室和塑料大棚一般具有较强的环境调控能力，可减少病害的发生；并且能将通风口处用防虫网封严，防止虫害发生。
由于盆栽果蔬对肥水要求更为精细，因此应装备灌溉施肥一体化系统，对植株进行肥水管理，最常用的是滴箭灌溉或潮汐式灌溉，配备精确施肥系统或营养液池进行施肥。在肥料的选择上，由于无机营养液具有营养全面、含量高、干净等优点，解决了栽培容器容量小的缺点，同时没有气味，利于家庭和餐厅摆放，因此通常把无机营养液作为肥料来源。
在基质的选择上，由于盆栽果蔬要兼顾观赏功能，因此建议采用无土栽培基质，不但美观、轻便，而且有利于植株的长势。一般可选用的基质包括椰丝、泥炭、蛭石、珍珠岩等保水性和透气性良好的材料。另外，对于部分观果类的盆栽果蔬，还应进行株形调整，如对观赏番茄、观赏椒、观赏茄子等进行整枝，避免其徒长，促进多分枝。对于观赏瓜类，还应设立支架，以防止植株果实过重而压垮植株。
