在不破坏菜籽油的情况下，不可能完全去除。芥酸在菜籽油里并不都是单独存在的，它往往和其他脂肪酸一起跟甘油基结合在一起，形成甘油脂肪酸三酯，换句话说，组成菜籽油的甘三酯分子中往往有芥酸也有其他脂肪酸。所以不破坏分子的情况下，无法完全去除。
现在已经有低芥酸的菜籽油了，如果需要可以直接选用这种产品。
芥花油是菜子油的一种，但和油菜籽油是有区别的。菜籽油的原材料有三种，一种是油菜籽、芥子、还有一种忘了。芥花油是低芥酸的菜籽油，油菜籽的是高芥酸的。市场上卖的绝大多数是油菜籽榨的。
低芥酸菜籽油有保健功能
1、对正常人群的降血脂作用：采用低芥酸菜籽油来代替饮食中的饱和脂肪酸，与采用多不饱和脂肪酸具有同样显著的降低血浆中总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇作用。
2、对高脂血症人群的降血脂作用：Lichtenstein、Gustafsson和Sodergren等的研究均表明，低芥酸菜籽油对高脂饮食和低脂饮食的高脂血症人群同样具有降低血脂中总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇的作用。
3、缓解血栓：低芥酸菜籽油能减少体外血小板中血栓素的形成，减少血小板凝结，对血液凝结时间具有延长作用，从而缓解血栓形成。
4、缓解心律不齐症状：心律不齐是导致突然死亡的一个重要因素。在心律不齐模型小鼠中，菜籽油、橄榄油、葵花籽油和大豆油等受试物饲喂12周后，研究结果表明菜籽油是惟一具有减少心律不齐作用的，这可能主要是由于菜籽油中n-3/n-6脂肪酸比例适当，尽管大豆油中含有相同含量的亚麻酸，但其中的亚油酸含量较高。
5、 防癌作用：W.ElaineHardman等研究表明，与其他植物油相比，孕妇食用低芥酸菜籽油可降低新生婴儿患癌症的风险。
