水酶法的原理是在机械破碎的基础上，对油料组织以及脂质复合体进行酶解处理。纤维素酶、半纤维素酶、果胶酶等能破坏细胞壁，而蛋白酶则渗透到脂质体膜内，对脂多糖、脂蛋白进行降解，有利于油脂从脂质体中释放，提高出油率。效果更科学跟先进，目前国内的俊启粮油研究颇深。
