1、栽植穴口小而腹大，可给裸根盆栽苗打上泥浆，及时栽入石穴内，填土压实（可用小棍棒捣实，注意不要伤到植物根系。），栽植完成，浇次透水，后期通过喷、洒水增加湿度，保养直至成活。
2、对种植穴较大，可用带土的小盆栽苗栽种，可掏去过大表层土，带护根土一起栽植，正常管理养护，较易成活。
3、利用假山石的峰间山谷处，填土成穴栽植，可用带护根土盆栽苗。
适合山水盆景种植的木本植物有:小叶罗汉松、五针松、黑松、真柏、地柏、龙柏、火棘、榆树、杜鹃等枝叶细小的植物，草本植物主要有水旱都适合的铜钱草、虎耳草、石菖蒲、酸浆草等小型植株，还有适应潮湿环境的铁线蕨，其实用文竹装点山水盆景的效果特好，山水盆景使用最多的植物还是苔藓。
铁线蕨、虎耳草、金钱蒲、常春藤等。如果是珊瑚石，种铁线蕨最好（当然要泡去盐分）。 由于上水石盆景种类繁多，不同的盆景植物的生活习性不同。在养护上水石盆景时首先要注意的便是植物的习性，比如喜阳植物因应在向阳通风处，喜阴植物注意避光;喜暖植物应摆在温度适宜的室内，喜寒植物可以放在较为通风的地方，如此种种。另外要强调的一点就是要勤换水，因为上水石盆景中植物是从上水石中吸取水分，而盆中的水又是不流通的，如果长时间不换水很容易导致水质污染。换水时的水量也要因植物而异，过多或过少都可能对植物有害。在水中加入适量的营养液会有助于植物的生长，但是要注意勤洗盆底以防细菌的滋生。植物上的枯叶要及时处理掉，发现有病虫害时要及时处理，这些小细节都可能会导致植物的死亡，从而影响整个盆景的美观。
