应该是在鸡的食物上下的功夫。有益微生物可以进入鸡内肠道中调节消化系统，提高鸡的免疫力和消化能力。还有一种电视上报导的：将能够分解氨的微生物混合到食物中，这样鸡拉出来的粪便不臭。
EM菌养鸡很好的，（一）它的主要作用如下，
一、提高成活率：用农盛乐em菌液给雏鸡开口，与抗生素相比较，有几大好处：
1、 使有益菌群迅速在肠道内占据优势，调节肠道内微生态平衡。
2、 对肠道无任何刺激，保护肠道内黏膜
3、 有效预防雏鸡白痢、大肠杆菌等疾病的发生
4、 保肝护肾，调节机体内分泌，提高雏鸡免疫力
5、 有效促进雏鸡生长发育，通过饲喂农盛乐e能大大提高雏鸡成活率，提高5—10%。
二、提高整体鸡群的免疫力：用 农盛乐em菌液 制作发酵料（或饲喂公司配制的发酵料），长期饲喂，可以有效的明显的刺激胸腺、脾脏和法氏囊的发育，提高鸡群的免疫功能，同时能明显增强T或B淋巴细胞的活性，明显增强机体的细胞免疫和体液免疫。
三、提高饲料转化率：用农盛乐em菌液（畜禽欢）制作成发酵料，长期饲喂，能激活与蛋白质和碳水化合物代谢有关的酶，从而提高它们的利用率。使其消化率明显的提高，有助于消化过程。同时能提高对钙、磷等多种微量元素的吸收利用率。
四、有效减少发病率：用农盛乐em菌液制作发酵料饲喂，可以有效的阻止沙门氏菌、大肠杆菌、霉菌、球虫等致病微生物和寄生虫的生长和繁殖，促进有益菌的生长。长期维护肠道微生物菌群的平衡。有效减少发病机率。
五、促生长：通过饲喂农盛乐em菌液制作的发酵料，能在肉鸡养殖中的35日龄前明显的促进生长发育，提高平均重量。
六、提高品质，降低药残：通过长期饲喂 EM发酵料，可大幅的提高肉鸡的肉质品质，大幅降低药残。
我们这边有几家都是用的农盛乐EM菌液养鸡，效果看的见。具体你可以咨询农盛乐技术员。
（二）、农盛乐em菌液在养鸡上的具体用法用量：
一、饮用保健：第1～2周稀释200～500倍使用；3～4周稀释500～1000倍使用；以后1000倍使用。（如配合有发酵料饲喂，则饮水量稀释加大一倍）
二、饲料发酵：按饲料重量的0.2～0.5%加入农盛乐em菌液，拌均匀，调节水分在55%左右，密封发酵3～7天，即可饲喂（可以发酵豆渣、潲水、秸秆、酒糟等喂鸡）
发酵豆渣的方法：(无论发酵那种饲料，方法和原理都是一样的)
（1）配料：稻草或秸秆粉粉碎后5～20%，豆渣占65-75%，农盛乐饲料发酵液的使用量按3‰添加，其余可用玉米粉或米糠，其中玉米粉或米糠和豆渣的比例可根据豆渣水分等实际情况进行适当的调整。
（2）混合：将发酵的物料充分拌均匀，再加水拌匀，物料含水率一般控制在50%～60%之间。其判断办法为：将拌好的物料紧抓一把，指缝见水印但不滴水，松开落地即能散开为适宜。若能挤出水汁，落地不散开，则含水率大于75%，太干太湿均不利，应调整。
（3）密封发酵：拌匀后随即装入盆、缸、池、塑料袋等容器中，用塑料薄膜覆盖好，夏天30度以上气温下密封发酵5天左右，25度发酵7天左右，20度发酵10天左右，温度越低发酵时间越长，可根据当地实际情况调整发酵时间。待物料有香、甜、酒气时即可饲喂。大规模发酵时可直接堆放在干净的水泥地板或发酵池中，加盖塑料薄膜密封发酵即可。
饲喂方法：饲喂发酵料应由少到多逐渐饲喂，一般从5%开始添加，最大添加量为30%为宜。
注意事项：
在发酵饲料时，有时会用到过磷酸钙（即磷肥）或磷酸氢钙来促进发酵，但不是什么饲料都可以添加的，而是需要有针对性地添加。
三、拌料：将农盛乐em菌液加适量水和红糖稀释后，均匀喷洒在饲料上，1kg农盛乐em菌液可以拌200～500公斤的饲料，饲料要现拌现喂，当天喂完。
四、疾病预防饮用：疾病高发期时，在认真执行免疫程序的基础上，每天使用e菌液1次，连饮5～7天。小雏鸡：每次0.1～0.5ml；（其它畜禽可参考上述用量适当调整）
五、圈舍除臭：将农盛乐em菌液稀释50～100倍，每平方米喷洒稀释液50ml-100ml，一周2～3次，疾病高发期一周3～5次。
六、制作发酵床：
土著菌养鸡技术，其实就是通过提取土壤中一些生命力和适应性很强并且具有很强分解力的有益微生物组成土著菌，然后利用土著菌将鸡粪中的有机物转化为鸡的饵料的一种生态养鸡技术。它能有效地处理鸡粪，消除臭味，省去了清粪工作，大大改善了养鸡环境，提高了饲料利用率，减少了鸡的发病，最终提高了养鸡的综合效益。
土著菌养鸡实际上只是微生物技术在农业养殖业中的一个典型例子，其实通过微生物技术的开发，还可以进一步研究养猪、养鸭等养殖行业的先进技术，为新农村建设提供强有力的技术保障。
制作30平方米养鸡发酵床的过程：
一、准备好原料：农盛乐em菌液30公斤（也可使用农盛乐发酵床菌种，比较经济划算），70～80％的惰性物质（锯木，稻壳，花生壳，粉碎秸秆、玉米芯等之类的不容易腐烂的物质），20～30％的营养物质（麦麸，稻糠，玉米粉之类的有营养的物质），水若干（刚开始先少放些，湿度不够再加，做到40～50％的湿度就行）。百分之10的深层土。
二、把农盛乐em菌液一半均匀混合到准备的水中，另15公斤菌液和百分之二三十的营养物质（麦麸或者稻糠玉米粉，一般情况下用麦麸或玉米粉60公斤左右）混合到一起，湿度拌到50％左右。
三、把惰性物质（锯木之类的）和营养物质（麦麸之类的）还有土混合到一起，一边混合一边用稀释过的农盛乐em菌液喷洒，一边撒30公斤农盛乐em菌液混合后的营养物质。拌匀的垫料的湿度一般为45%左右（用手握下垫料，手缝有水滴，但不会滴下来）。
四、最后，我们把步骤三中的垫料堆放到一起，再用塑料薄膜封闭起来发酵，温度20摄氏度以上，发酵3～5天即可，低于20摄氏度，则要发酵5～7天。
我使用的农盛乐发酵床菌种制作的发酵床，小鸡在发酵床上生活的很愉悦。看到小鸡这么愉悦我也很开心。你百度搜索下 农盛乐 就找到他们技术员了，最好找到王经理，人很热情也很专业。
发酵床垫料的更换：
牲畜每批次转栏或出栏后，应对圈舍进行全面立体的消毒处理，然后补充部分新鲜木屑或秸秆粉及适量农盛乐EM原液，调节水分至50%左右，将垫料在圈栏中堆积起来进行发酵处理，温度上升到50℃以上高温24小时后，即可作为发酵床垫料重新使用。
生态环保发酵床养殖的优势概括为：五省、四提、三无、二增、一少、零排放。
五省：省水、省工、省料、省药、省电。
四提：提高肉品质、提高免疫力、提前出栏、提高肉料比。
三无：无臭味、无蝇蛆、无环境污染。
二增：增加经济效益、增加生态效益。
一少:减少动物体内药物残留。
零排放：粪尿全部在圈舍内降解，没有污水和粪便向外排放。
（1）、减轻对环境的污染采用发酵床养殖技术后，由于有机垫料里含有相当活性的土壤微生物，能够迅速有效地降解、消化畜禽的排泄物，不再需要对畜禽粪尿采用清扫排放，也不会形成大量的冲圈污水，从而没有任何废弃物排出养殖场，真正达到养殖零排放的目的。舍内不会臭气冲天和苍蝇滋生。
（2）、改善舍环境、提高肉品质发酵床结合特殊圈舍，使圈舍通风透气、阳光普照、温湿度均适合于畜禽的生长，再加上运动量的增加，畜禽能够健康地生长发育，几乎没有疾病发生，也不再使用抗生、抗菌性药物，提高了畜禽肉品质，生产出真正意义上的绿色有机肉。
（3）、变废为宝、提高饲料利用率 在发酵制作有机垫料时，需按一定比例将锯木屑、稻壳等加入，通过土壤微生物的发酵，这些配料部分转化为畜禽的饲料。同时，由于畜禽健康地生长发育，饲料的转化率提高，一般可以节省饲料10％～30％。
（4）、节工省本、提高效益由于发酵床养殖技术不需要用水冲圈舍、不需要每天清除畜禽粪便；畜禽体内无寄生虫、减少疾病产生；采用自动给食、自动饮水技术等众多优势，达到了省工节本的目的。一个人可饲养500～1000头壮猪，100～200头母猪，可节水90％，每头猪节省水费6元，节约用工3元，节约驱虫药费1元左右，在规模养殖场应用这项技术，经济效益十分明显。
