全国畜牧总站与全国畜牧兽医总站是一个单位。
全国畜牧总站是农业部的直属事业单位（正厅级），与中国饲料工业协会一套机构，两块牌子。主要职责为：承担全国畜牧业（包括饲料、草业、奶业）良种和技术推广，畜禽、牧草品种资源保护与利用管理，畜牧业质量管理与认证，草地改良与生物灾害防治等工作的国家级技术支撑机构。全国畜牧总站（中国饲料工业协会）业务归口农业部畜牧业司管理，机构规格为正局级。
主要职责：
一是协助畜牧行政主管部门拟定畜牧业有关法律、法规和政策建议，受委托承担全国畜牧业管理的具体工作，提出行业重大技术进步措施建议。
二是研究提出全国畜牧业技术推广规划和体系建设规划，指导全国畜牧业技术推广体系建设及推广机构、饲料工业协会的业务工作，组织开展全国畜牧业技术推广和专业技术人员培训，负责全国畜牧业职业技能鉴定工作。
三是承担畜禽、牧草、饲料品种资源的调查、保护与管理工作；组织实施相关品种的审定、登记、引进、繁育、推广工作。
四是承担畜牧业产品质量安全管理和认证及相关标准和技术规范的拟订工作；推广畜禽健康饲养方式，承担养殖环境监测与监督管理工作。
五是承担畜牧业统计和经济运行分析工作；承担畜牧业市场体系建设和畜产品加工业务指导工作；组织开展畜牧业技术合作与交流；开展畜牧业国际贸易相关政策、法规研究，参与协调国际贸易争端。
六是承担畜牧业行政许可事项及国家级畜禽遗传资源保护场、保护区和基因库的审核工作；承担畜牧业项目的相关管理工作。
七是组织实施草场改良和草原病虫鼠害防治工作；承担草原监测的技术支持与服务工作。
八是承担中国饲料工业协会的日常工作；组织开展饲料行业自律性管理和行业评价，指导企业改革与管理；承担畜牧业相关技术委员会的日常工作，指导挂靠社团的业务工作等。
