天麻为两性花,花药在合蕊柱的顶端,雌蕊柱头在蕊柱下部,花粉粒之间有胞间连丝相连,花粉呈块状不易分开。自然条件下靠昆虫传粉,自花和异花均可授粉结实。在野外自然状态下结实率仅有20%。人工栽培时进行人工授粉,结实率可达90%以上,并且果实饱满,种子优质。